También jugó en la tercera categoría, Segunda División B del fútbol de Costa Rica.
Así en 1979 subieron al torneo distrital y cantonal de tercera división, pero sin mayor trascendencia.
Pero a nivel de cuartas logran el título provincial ganándole tres goles por uno al juvenil del C. Deportivo Yuba Paniagua.
Por este equipo pasaron jugadores como Marvin Obando, José Manuel “gugui” Ulate, entre muchos que jugaron en la primera división.
Ya en 1981 los cubujuqueños del Ortho buscan mejores horizontes y forman una selección junto a la escuadra del Atlético Cubujuquí, y así se nace el Club Deportivo Muñóz Corea de Almacenes ALCOSA.