Pese a que sus inicios son anteriores a la década de 1980, es durante esta época cuando se disputan los primeros torneos asociados, generalmente con jugadores pertenecientes al área juvenil.
Este equipo fue dirigido por el técnico argentino Vicente de Luise y contó como refuerzos a los jugadores Gabriel Valarin y Gustavo Romero, todos parte del plantel albiceleste que participó en la Copa Mundial de fútbol sala de la FIFA 1992.
Luego de varios intentos del resurgimiento durante la década de los noventa, que estuvieron más cercanos al Showbol, la rama entra en receso.
La rama volvió a la cancha en 2016 cumpliendo una gran campaña durante el debut.
Esto hizo que Blanco y Negro S.A. entregara su administración al CSD Colo-Colo a partir de 2019.