Fundado el 16 de julio de 1914, inicialmente con el nombre Club Paso Ñandejara, para unos años después cambiar al nombre actual Sportivo Limpeño.
[3] En su primer año en la Primera División C no solo obtuvo el ascenso a la Primera B (Tercera División),[4] sino también se consagró campeón.
[8][9] El estadio del club lleva el nombre de Optaciano Gómez en honor a un antiguo presidente del club, el escenario también es conocido popularmente como El matadero.
En su primera participación en la Copa Libertadores Femenina 2016, gana su grupo accediendo a la semifinal del certamen y luego logrando el título de campeón en forma invicta tras ganar la final al club venezolano Estudiantes de Guárico por el marcador de 2 a 1, con goles de Liz Peña y Damia Cortaza.
[10][11][12] El equipo campeón estuvo conformado por Kimika Forbes, Laurie Cristaldo, Stephanie Lacoste, Carmen Benítez, Damia Cortaza, Joana Galeano, Rosa Aquino, Liz Peña, Jessica Martínez, Griselda Garay y Marta Agüero, también ingresaron Liza Larrea y Dulce Quintana, bajo la dirección técnica de Rubén Subeldía.