La coenzima M es un anión con fórmula molecular HSCH2CH2SO3-.
Recibe el nombre de 2-mercaptoetanosulfonato y se abrevia HS-CoM.
La forma neutra (un ácido sulfónico, HS-CH2-CH2-S(=O)2OH) carece de importancia, pero la sal sódica está disponible la mayoría de las veces.
Es convertido en propil coenzima M, el tioéter CH3SCH2CH2SO3-, en el penúltimo paso en la formación de metano.
[1] La conezima M reacciona con la coenzima B, el 7-tioheptanoíltreoninafosfato, para dar un heterodisulfido, liberando metano: Esta conversión está catalizada por la enzima metil coenzima M reductasa, que contiene el cofactor F430 como grupo prostético.