En la era prehispánica el territorio estuvo poblado por descendientes de los Perica que vivieron a las orillas del río Daule y posteriormente se denominaron Colinos.
Posteriormente, un nuevo grupo de colimeños, entre los que se contaban Aracely Carbo, Matilde Luna, Carlos Briones, Virgilio Rivas, Carlos Bravo, junto con el prestante sacerdote irlandés Desmond Oliver Dalton, quien había llegado a Colimes a inicios de los años 80, retomaron el movimiento Pro-cantonización de Colimes.
La Ley de Creación del Cantón Colimes indica que "ha logrado un notable desarrollo en lo poblacional, cult[3] ural, urbanístico y económico" razones que la elevaron a la categoría de cantón.
El Gobierno de León Febres Cordero negó en primera instancia la cantonización insistiendo el Presidente del Congreso Jorge Zavala Baquerizo, al año siguiente, decretando la cantonización por el imperio de la ley.
La ciudad y el cantón Colimes, al igual que las demás localidades ecuatorianas, se rige por una municipalidad según lo estipulado en la Constitución Política Nacional.