Como resultado, el complejo mayor de histocompatibilidad humano también puede ser llamado el sistema HLA.
Originalmente, las proteínas MHC se consideraron de interés sólo en lo que respecta a los trasplantes de órganos porque trasplantes en los que el donante y las células receptoras contenidos diferentes proteínas MHC resultó en el rechazo de órganos a menos que el sistema inmune se suprime.
[2] Los genes del CMH también están involucrados en varias funciones no inmune tales como el olfato[2] y auto/no auto-reconocimiento.
[1][3] Los genes MHC, que controlan la respuesta inmune y la resistencia efectiva contra los patógenos, han sido capaces de mantener un nivel extremadamente alto de diversidad alélica en todo momento y en las diferentes poblaciones enteras.
Hay varias hipótesis propuestas que abordan cómo el MHC asociado a las preferencias de apareamiento podría ser adaptativa y cómo el MHC ha mantenido su enorme diversidad alélica.