El condado de Watonwan (en inglés: Watonwan County), fundado en 1860 y con su nombre dado por la palabra indígena watonwan que significa «donde abundan los peces», es un condado del estado estadounidense de Minnesota.
La sede del condado es St.
[1] Según la oficina del censo el condado tiene una superficie total de 1139 km² (439,8 mi²), de los que 1125 km² (434,4 mi²) son tierra y 14 km² (5,4 mi²) (1,23%) son agua.
Dispone de numerosos lagos con nombres tales como: Bergdahl, Bullhead, Butterfield, Case, Cottonwood, Ewy, Fedji, Irish, Long, Mary, Mud, Kansas, School, St.
En el año 2000 los hombres tenían unos ingresos anuales 29.242 dólares frente a los 19.788 dólares que percibían las mujeres.