El convento de San José en Brihuega (Guadalajara, España) es un convento de franciscanos de San José fundado por Juan de Molina hacia 1619 en unos edificios anejos a la muralla, en el prado de Santa María.
Lo habitaron frailes de la llamada «Reforma de la Orden del Carmelo» hecha por San Pedro de Alcántara y vivieron en él varones de probada santidad y muchas letras.
En su edificio se instaló en 1835 el hospital de la villa, fue cárcel en sus bajos, colegio y escuela taller, en la actualidad sala de exposiciones y un museo de miniaturas de la colección de Juan Elegido Millán.