La aristócrata Marina de Villaseca fundó en 1483 la primera congregación femenina de monjas franciscanas, quien trasladó en 1491 el monasterio a la ubicación actual tras la confirmación por el pontífice Inocencio VIII.
Dos años más tarde se efectuó la compra de la huerta y posteriormente unas casas anexas para ampliar todo el complejo.
[1] La autoría del complejo conventual es anónima debido a que se basa en la unión de diversas viviendas; no ocurre lo mismo con la iglesia, cuya ejecución fue realizada por el arquitecto Juan de Ochoa en 1583 y fue completada por Sebastián Vidal y Bernabé Gómez del Río en 1660.
[2] Los marqueses de Villaseca, antiguos patronos del cenobio, decidieron demandar este proceso de conversión en hotel, ya que se consideran promotores del mismo.
[6]En enero de 2025 dicha empresa declaró que quiere realizar un hotel de cinco estrellas en el antiguo convento.