Se dice que fue el más suntuoso de toda la Nueva España.
En el continente americano,los Mercedarios se instalaron primero en Guatemala, pero en 1582 algunos de ellos viajaron a la capital del Virreinato para realizar estudios.
El bello claustro que ha llegado hasta nuestros días fue construido entre 1676 y 1703 con la ayuda económica del Conde de Miravalle.
A comienzos del siglo XX, ante la amenaza de la demolición, el Dr. Atl (Gerardo Murillo), habitó durante un tiempo en el lugar para evitar tal acto.
Las columnas pertenecen al orden tritóstilo y están bellamente labradas; el primer tercio tiene un complicado entrelazado vegetal, mientras el resto del cuerpo se compone de bandas que se entrecruzan formando rombos, los cuales están decorados con racimos de uvas y flores; los capiteles son de orden corintio.
En el extremo sur del corredor oeste del claustro se encuentra la escalera monumental que conduce al segundo nivel; ésta se ramifica en dos brazos y remata en bellas portadas decoradas con ventanillas y arcos de medio punto; está cubierta por una cúpula con linternilla.