La COPA CECAFA de 1999 fue la edición número 23 del campeonato regional del África del Este.
Todos los partidos se jugaron en Kigali del 24 de julio hasta el 7 de agosto.
"Ruanda "B" terminó segundo por sorteo"
"Kenia ganó 4-1 en penales" "Ruanda ganó 3-2 en penales"