La competición se disputó bajo un sistema de eliminación con posibilidad de revancha, en las canchas ubicadas en el Parque Cousiño y en la Quinta Normal.
A comienzos del siglo XX, en Santiago no existía ningún tipo de organización que agrupara a los diversos clubes de fútbol que iban apareciendo y, en consecuencia, no se disputaba ninguna clase de torneo, a diferencia de lo que sucedía en Valparaíso, donde, desde 1895, funcionaba la Football Association of Chile y existía un campeonato anual.
En la capital, la actividad futbolística se limitaba a partidos amistosos y, ante la falta de organización que unificara las reglas, era común que los jugadores cambiaran continuamente de club.
[4] En su primera reunión ordinaria, el reciente directorio de la asociación, en presencia de representantes de 16 clubes, acordó restringir la inscripción, dada la gran cantidad de equipos, y dividir a los clubes en dos categorías: una Primera División, integrada por Atlético Unión, Thunder, Santiago National, Scotland, Tucapel, Deutscher Turnverein, Britannia, Victoria e Instituto Pedagógico; y una Segunda División, integrada por Victoria Rangers, Chile, el segundo equipo de Thunder, Cambridge, Bandera de Chile, Balmaceda, Brasil, Victorioso, Wilmington y Chilean Star.
El campeonato de Segunda División, cuyo trofeo en disputa era la Copa Junior, obsequiada por la Asociación de Santiago,[6] inició el día 31 de mayo de 1903 en las canchas del Parque Cousiño, ante una asistencia de cerca de tres mil personas, quienes presenciarion el triunfo del Victoria Rangers al Chile por 1-0.