La Copa de España de Fútbol Sala Femenino de 2006 tuvo lugar entre el 10 de febrero y el 12 de febrero en Las Matas (Comunidad de Madrid).
Es la decimosegunda edición de este campeonato español.
A la cita acudieron los ocho primeros clasificados.
Los cruces de cuartos se dilucidarán por orden estricto de clasificación al término de la Liga en Primera División, así el primer clasificado se medirá contra el octavo o en su defecto el anfitrión, el segundo contra séptimo, tercero contra sexto y cuarto contra quinto.
El torneo se disputó en Las Matas, en el Polideportivo Municipal de las Matas.