La 63.ª edición de la Copa del Rey de baloncesto se disputó en el Pabellón Fuente de San Luis de Valencia desde el 29 de enero al 1 de febrero de 1999.
Fue la segunda edición disputada en Valencia y el TAU Cerámica se proclamó campeón por segunda vez en su historia.
Los equipos participantes fueron: Unicaja Málaga, Real Madrid, TAU Cerámica, Pamesa Valencia, Baloncesto Fuenlabrada, FC Barcelona, Joventut Badalona y Caja San Fernando.