La Copa del Rey de balonmano 2003 fue la edición XXVIII del campeonato estatal de la Copa del Rey y se celebró en Santander (Cantabria) entre el 28 de mayo y el 1 de junio de 2003.
Los equipo clasificados fueron: BM Ciudad Real, BM Valladolid, Portland San Antonio, BM Altea, Club Balonmano Cantabria, BM Valencia, Ademar León y el FC Barcelona.
El ganador de esta edición fue el BM Ciudad Real, imponiéndose al FC Barcelona.