Tienen espinas aciculares delgadas, rectas, e inicialmente de color negro a marrón, volviéndose amarillas con el tiempo.
Tienen los tépalos de color amarillo pálido a blanquecino con rayas rojas y el nectario es tubular.
Se desarrolla entre rocas, a elevaciones entre los 450 y los 800 metros sobre el nivel del mar.
Copiapoa aphanes fue descrita por los botánicos británicos Wendelin Mächler y Helmut Walter, y publicada por primera vez en la revista científica Kakteen und andere Sukkulenten 56: 101 en el año 2005.
Además tiene un efecto muy negativo la perturbación antrópica derivada de la herbivoría por parte del ganado doméstico.