Generalmente crece de forma solitaria a ras del suelo, aunque ocasionalmente puede desarrollar hijuelos en la base.
Tienen muy pocas espinas y están completamente ausentes en la parte más vieja de la planta.
Inicialmente son de color marrón o negro y con el tiempo, aunque se vuelve gris ceniza, terminan cayéndose por completo.
Son de color amarillo a rojizo por fuera, se abren un solo día y desprenden olor.
Copiapoa hypogaea fue descrita por el botánico alemán Friedrich Ritter y publicada por primera vez en la revista científica Cactus (Paris) 15 (66): 19 en el año 1960.