Se distribuye únicamente en los Andes del centro sur y sureste de Perú.
[1] La especie C. marcapatae fue descrita por primera vez por el ornitólogo estadounidense John Todd Zimmer en 1935 bajo el mismo nombre científico; la localidad tipo es: «Marcapata, 10.800 pies [c. 3290 m], Cuzco, sureste de Perú».
[2] El nombre genérico femenino «Cranioleuca» se compone de las palabras del griego «κρανιον kranion» que significa ‘cráneo’, ‘cabeza’, y «λευκος leukos» que significa ‘blanco’, en referencia a la corona blanca de la especie tipo: Cranioleuca albiceps; y el nombre de la especie «marcapatae», se refiere a la localidad tipo: Marcapata, Cuzco, Perú.
[6] El par formado por la presente especie y C. weskei (de considerarse separadas) está hermanado con Cranioleuca albiceps.
[11][12] Según la clasificación Clements Checklist se reconocen dos subespecies,[7] con su correspondiente distribución geográfica:[13]