Actualmente es asistente técnico de Cesc Fàbregas en el Como 1907 de la Serie A (Italia).
Dani Guindos, ha entrenado a la cantera de varios equipos representativos del panorama nacional, como el Atlético de Madrid, el Rayo Majadahonda o el Real Madrid, dónde entrenó en las categorías inferiores del club blanco durante varios años.
Consiguiendo como mayor mérito en esta etapa la primera Copa Federación de la Real Federación Madrileña de Fútbol en 2018.
En septiembre de 2019 asumió el cargo de Seleccionador Nacional Absoluto de la Selección Nacional de Guinea Ecuatorial,[1] conocida popularmente como Nzalang, en la que estuvo durante un dos meses en el cargo pudiendo dirigir sólo un encuentro frente a la Selección de fútbol de Togo.
[3] El 18 de junio de 2021, se incorpora al Granada CF junto a Robert Moreno.