La diócesis de Agats (en latín: Dioecesis Agatsen(sis) y en indonesio: Keuskupan Agats) es una circunscripción eclesiástica latina de la Iglesia católica en Indonesia, sufragánea de la arquidiócesis de Merauke.
La diócesis tiene al obispo Aloysius Murwito, O.F.M.
La diócesis tiene 31 000 km² y extiende su jurisdicción sobre los fieles católicos de rito latino residentes en la provincia de Papúa en la regencia de Asmat y cuatro distritos en la parte norte de la regencia de Mappi (Citak Mitak, Kaibar, Passue Bawah y Ti Zain).
La sede de la diócesis se encuentra en la ciudad de Agats, en donde se halla la Catedral de la Santa Cruz.
[1] De acuerdo al Anuario Pontificio 2021 la diócesis tenía a fines de 2020 un total de 65 292 fieles bautizados.