La diócesis de Natitingou (en latín: Dioecesis Natitinguensis y en francés: Diocèse de Natitingou) es una circunscripción eclesiástica de la Iglesia católica en Benín.
La diócesis tiene 20 499 km² y extiende su jurisdicción sobre los fieles católicos de rito latino residentes en el departamento de Atakora.
En la parroquia Santa Teresita del Niño Jesús (que comprende unos 20 pueblos), algunos sacerdotes diocesanos, enviados como misioneros fidei donum, prestan el servicio pastoral.
Una pequeña comunidad de monjas trabaja junto a los sacerdotes.
Según el Anuario Pontificio 2022 la diócesis tenía a fines de 2021 un total de 216 340 fieles bautizados.