Desde la Edad Media hasta el siglo XIX, Sapë perteneció a la provincia eclesiástica de Bar.
En 1444 se unieron las tres diócesis de Dagno, Sarda y Sapë, pero la unión duró poco.
En la primera mitad del siglo XVI la diócesis experimentó un período de decadencia.
En un principio fue asignada in commendam a prelados no residentes, luego pasó por un largo período de vacancia, que duró hasta 1560.
Durante el período de ateísmo estatal, la diócesis permaneció vacante desde 1948 hasta 2005.