Inmediatamente por encima de estas categorías estaba la Tercera División española.
En la temporada 1999-2000 la Territorial Preferente constituyó el quinto nivel de competición futbolística en la Región de Murcia siendo la única y más baja categoría del fútbol regional.
La acumulación de equipos obligó a crear dos grupos,[1][2] ampliándose las divisiones regionales para la próxima temporada, restaurando la categoría de Primera Territorial.
Los cuatro primeros ascienden a Tercera División.
Se acumulan los resultados de la primera fase.