La NCAA le otorgó esta temporada como nula debido a su lesión, empezando la siguiente otra vez como freshman.
Sólo pudo jugar 4 partidos antes de su lesión (ninguno como titular), promediando 1,7 puntos y 1,2 rebotes en 7 min.
Anotó 5 puntos (máxima de la temporada) en la victoria por 64-55 en primera ronda del U.S.
Virgin Islands Paradise Jam, tras derrotar en la final por 62-54 a los Winthrop Eagles.
Disputó un total de 11 partidos (ninguno como titular) en la temporada y media que jugó con los Baylor Bears, promediando 2,2 puntos (50 % en triples; 2-4) y 2,7 rebotes en 12,1 min de media.
Anotó 9 puntos en la victoria contra los UNLV Rebels, el 18 de febrero de 2009, actuación que impresionó ya que se había dislocado parcialmente el hombro izquierdo el sábado anterior contra los San Diego State Aztecs.
Hizo su primer doble-doble de su carrera universitaria en la victoria contra los Sacramento State Hornets (11 puntos y 10 rebotes; siendo éste sólo su tercer partido como Cowboy).
En su primer partido como Cowboy (en la victoria contra los Northern Iowa Panthers en el torneo de la NCAA), anotó 3 puntos, cogió 7 rebotes y puso 2 tapones.
Dio grandes pasos para convertirse en un jugador de mayor impacto en la Mountain West Conference.
Finalizó en la Mountain West Conference como el 11º en rebotes por partido, el 10º en rebotes totales (163), el 8º en tapones por partido (0,8), el 8º en tapones totales (26) y el 2º mejor % de tiros de campo.
En el partido contra los Peru State Bobcats puso 4 tapones (máxima de su carrera universitaria).
En su quinta y última temporada, su año senior (2010-2011), se erigió como un líder para los Cowboys, siendo además uno de los mejores jugadores del equipo.
Fue uno de los dos únicos jugadores seniors del equipo, junto con Rob Watsabaugh.
Con ellos ganó la Emir Cup tras derrotar por 81-56 a Al-Ravyyan (Thiam anotó 14 puntos).
Quedó subcampeón de la ABA tras perder en la final contra los Jacksonville Giants.