Fue conocido por oponerse a las influencias de la Iglesia católica y del protestantismo.
En 1666, fue consagrado arzobispo de Cesarea Marítima (actualmente Caesarea, Israel).
En 1672, el Patriarca Dositeo convocó el Sínodo de Jerusalén que rechazó todas las doctrinas calvinistas y reformuló las enseñanzas ortodoxas de manera que se distinguieran del catolicismo y del protestantismo.
[3] Dositeo II Notaras viajó por Bulgaria para recoger ayudas para el Santo Sepulcro en 1659-1664, acompañando al patriarca Paisius de Jerusalén , y en 1663-1664, cuando acompañó al patriarca Nektarius de Jerusalén.
En 1715 se publicó su Historia del Patriarcado de Jerusalén en doce volúmenes.