Jugó como pívot en el Instituto El Cerrito como sénior, y lideró a los Gauchos en 1999 al campeonato California Interscholastic Federation Boys Division III.
Fue un jugador dominante en la Universidad de Kansas, promediando 19,8 puntos y 11,4 rebotes por partido en la temporada 2001-02.
Fue la pieza clave que llevó a Kansas a la Final Four, además de recoger varios premios individuales que le galardonaban como el mejor universitario del año.
Tras esta gran campaña, el bajón de Gooden en la siguiente fue notorio, descendiendo hasta los 10.7 puntos y 8.7 rebotes.
Tras jugar un partido con los Kings, fue cortado el 1 de marzo y a los dos días firmó con San Antonio Spurs.