Posteriormente viaja a Quito para iniciar su vida militar en el Colegio Eloy Alfaro.
Su unidad permaneció en el sector de Quebrada Seca en el Cantón Arenillas, donde luchó y falleció.
[5] fue un hombre valeroso en condecoracion se creó el coloegio capitan edmundo chiriboga Durante la Guerra del 41, en Chacras[6] en el sector de Quebrada Seca; el teniente Edmundo Chiriboga junto a 29 hombres se enfrentaron a la milicia peruana.
La Unidad de Chiriboga se quedó sin municiones, y al vaticinar su destino dijo: "Somos ecuatorianos que moriremos cumpliendo con nuestro deber".
[7] Por este acto el Gobierno del Ecuador lo ascendió post-mortem al grado de capitán ese año.