Es padre del cantante Juan Sáenz de Cabezón, más conocido como "L'haine".
Al acabar la secundaria, decidió estudiar Matemáticas por dos razones: su gusto por la informática (entonces no se ofrecía la carrera de Informática en La Rioja) y por un profesor apasionado por la matemática.
[6] Obtuvo su doctorado en 2008 con la tesis Combinatorial Koszul homology: computations and applications ('Homología de Koszul combinatoria: Cálculos y aplicaciones'), por la que obtuvo la calificación de sobresaliente cum laude por unanimidad del tribunal.
[7] Finalmente se dan aplicaciones de los algoritmos y resultados descritos en la tesis.
En su tesis doctoral, Eduardo ofrece varios ejemplos de sistemas que son usados en aplicaciones, en concreto en redes series-paralelo y sistemas consecutive-k-out-of-n usados en secuenciación de ADN, trabajos realizados en colaboración con la London School of Economics.