En 1931 fue nombrado también presidente del Ateneo de Alicante.
En 1934 fue secretario del nuevo partido Izquierda Republicana, y fue detenido a raíz de la huelga general del 5 de octubre de 1934.
Cuando estalló la sublevación militar que dio lugar a la guerra civil española (1936-1939) formó parte del Comité Provincial del Frente Popular que impidió el triunfo de los sublevados, y luego fue Comisario Civil de Reclutamiento del Ejército Republicano en Murcia.
Al acabar la guerra fue detenido por las nuevas autoridades, juzgado, condenado a muerte y ejecutado el 5 de mayo de 1939, a los 49 años.
En Alicante, en el barrio de Lo Morant-San Nicolás de Bari, existe la calle del Catedrático Eliseo Gómez Serrano en su recuerdo.