Comprende 3 especies descritas y de estas, solo 2 aceptadas.
[1] El género fue descrito por Theodor Carl Julius Herzog y publicado en Mededeelingen van's Rijks-Herbarium 46: 3.
[2] La especie tipo es: Enneatypus nordenskjoeldii Herzog.
A continuación se brinda un listado de las especies del género Enneatypus aceptadas hasta mayo de 2014, ordenadas alfabéticamente.
Para cada una se indica el nombre binomial seguido del autor, abreviado según las convenciones y usos.