Se casó en 1487 con Ingeborg Philipsdatter (que murió en 1495) su prima materna, y vivió con ella en la mansión de Ekholmen en Uppland.
Su segunda esposa era bisnieta del rey Carlos VIII de Suecia.
Los padres de Erik eran Arvid Birgersson Trolle (muerto en 1505 y su primera esposa Kerstin Jonsdotter (Gädda).
El padre de Erik contraería un tercer matrimonio con Brita Turesdotter Bielke.
Erik fue elegido Regente (riksföreståndare) en una reunión del Alto Consejo de Suecia en 1512 a la muerte del Regente Svante Nilsson, Señor de Ekesiö, pero nunca llegó a asumir el puesto, que fue ocupado por el hijo de su rival, Sten Sture el Joven.