Entre sus discípulos destacan Paul Dukas, André Gedalge, Claude Debussy, Erik Satie i Mel Bonis.
Influyó notablemente en Claude Debussy - publicación de las notas tomadas durante las discusiones amistosas por Maurice Emmanuel en su libro dedicado a "Pelléas y Melisande".
Su Primera Suite de orquesta, ejecutada en 1872 en los Conciertos Populares tuvo una buena acogida y su Carnaval todavía se interpreta.
Mantuvo una gran amistad con Georges Bizet, cuya partitura de la ópera Carmen enriqueció con los recitativos que incorporó a la misma reemplazando los diálogos originales.
Su ópera Frédégonde, drama lírico en tres actos fue terminada por Camille Saint-Saëns y por Paul Dukas en 1894.