La estación de Schlatt fue abierta en el año 1894 con la inauguración del tramo Schaffhausen - Etzwilen de la Seelinie Schaffhausen - Rorschach por el Schweizerische Nordostbahn (NOB).
La estación se encuentra ubicada en las afueras del noroeste del núcleo urbano de Schlatt, a más de 2 kilómetros del centro urbano.
Consta de dos andenes centrales a los que acceden dos vías pasantes, a las que hay que añadir una vía topera y una derivación a una industria.
La estación está situada en términos ferroviarios en la línea Schaffhausen - Rorschach.
Sus dependencias ferroviarias colaterales son la estación de Langwiesen hacia Schaffhausen y la estación de St.