Estonia participó en los Juegos Olímpicos de la Juventud 2018 en Buenos Aires, Argentina, celebrados entre el 6 y el 18 de octubre de 2018.
La delegación estuvo conformada por 23 atletas y obtuvo una medalla de bronce en las justas.
Las medallas entregadas a los participantes de los equipos mixtos se representan en cursiva.