[8] Estas fortalezas pueden dejarse vacías o estar tripuladas por los personajes del jugador.
[10][11] Durante el desarrollo, ambas compañías compartirían continuamente sus datos más recientes en un servidor compartido y discutirían los detalles de la dirección del juego usando un programa de mensajería instantánea; Además, mantenían reuniones semanales durante las cuales hacían varios arreglos para el juego, y cada mes durante el desarrollo Spike Chunsoft enviaba su última versión jugable a Atlus, quien verificaba la dirección en la que iba el juego.
Otra clase que se consideró para el papel de «atacante a distancia» fue el Arbalist (una clase de Etrian Odyssey III: The Drowned City), pero debido a su alto daño, habría sido muy difícil equilibrar el juego si se hubiera incluido.
Otro factor en la elección del Gunner fue que ya era una clase popular en la serie Etrian Odyssey y se había convertido en figuras en Japón.
[10] Atlus USA, la subsidiaria estadounidense de Atlus, comenzó a trabajar en una localización al inglés del juego antes de que el desarrollo hubiera terminado, lo que resultó en un lanzamiento en inglés solo un mes después del lanzamiento original en japonés.
[14] De manera similar, la primera impresión del lanzamiento norteamericano vino con un conjunto de elementos adicionales titulados «The Sights and Sounds of Mystery», que incluye un CD de banda sonora con versiones arregladas de seis canciones del juego; un libro de 28 páginas con ilustraciones del juego, así como información destinada a ayudar al jugador a formar su grupo en el juego; y una caja que contiene el juego y otros ítems.
Desde el final de ese período, el contenido está disponible para su compra para los jugadores que no lo hayan descargado durante el primer mes.
[20] Famitsu le dio al juego una puntuación de 34/40 en su reseña, con las subpuntuaciones 8, 8, 9 y 9.