[1] Nuevamente senador más de diez años después, asumió la presidencia del Senado en 1878.
Su oposición a Antonio Guzmán Blanco en el Congreso durante el debate sobre la reforma constitucional que buscaba reducir a 9 los 20 estados de la República (1880), que Baptista calificó de «monstruoso» y de «Constitución Suiza», hizo enfadar a Guzmán Blanco.
La Cámara, sometida ante la voluntad de Guzmán, aceptó levantarle la inmunidad parlamentaria.
[1] Buenaventura Macabeo Maldonado, entonces diputado por Táchira, protestó por su encarcelamiento, al considerarlo injusto, lo que le valió el arresto también por parte del régimen guzmancista.
Regresó a Caracas durante el gobierno de Juan Pablo Rojas Paúl y publicó el folleto Historia de un gran crimen (1890), en el cual denunció el atropello del cual había sido objeto en 1881.