Chapuis, desde joven se interesó por la historia natural y biología.
Estudió medicina en la Universidad de Lieja, donde se entrevistó con el también, entomólogo Ernest Candèze, y también médico.
Ambos se interesaban por escarabajos y fue profesor de zoología; y, con Jean Théodore Lacordaire trabajaron especialmente en estudios sobre larvas de escarabajos.
Se interesó también por la botánica publicando al respecto, y escribió un libro sobre la orientación de las palomas.
Además de los ya mencionados libros: La abreviatura Chapuis se emplea para indicar a Félicien Chapuis como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.