En el parque nacional Cañón del Sumidero, todavía existen especies endémicas de aves que hace décadas fueron abundantes en el resto del municipio: Papamoscas fajado (xenotriccus calliconus), cinco real (dactylortyx thoracicus), cuiche (colinus virginianus) y chachalaca (ortalis vetula).
Especies de aves menos abundantes que hace décadas, pero todavía comunes son: Urraca (calocitta formosa), chorcha (icterus sclateri), cotorra común (aratinga canicularis), cotorra de cueva (aratinga colochora), paloma bravía, torcaza morada (columba flavitrostris).
En otoño arriban las tórtolas (Zenaidura macroura), caminera (leptotila verrauxi), tortolita (scardafella inca).
Todavía son comunes: el [Dasypodidae|armadillo], la zorra gris (Urocyon cinereoargenteus), el leoncillo (felix yagouaroundi), la comadreja (mustela frenata), tlacuache, el cuatro ojos (philander opposum), el ratón tlacuache (Marmosa mexicana), varias especies de ratones silvestres, la rata gigante (tylomis nudicandus), muchas especies de murciélago y el vampiro.
Las únicas tortugas nativas del municipio son los "casquitos" y una de nombre científico (Kinosternon abaxillare).