En el servicio militar, Fernando tomó parte en las campañas de Italia y de Hungría, y eventualmente se convirtió en el general, el teniente general y propietario del imperial Regimiento de Infantería Nº 26.
[2] Después de que en los hospitales de Brno, donde estaba Fernando, se produjeran cada vez más muertes, el archiduque inspeccionó los hospitales y se contagió allí de tifus.
Fue enterrado en la Iglesia de San Vicente, en Módena.
Isabel y Fernando tuvieron una hija, María Teresa (1849-1919), quien se convirtió en la última reina de Baviera, por su matrimonio con Luis III de Baviera.
Su viuda se volvió a casar con el archiduque Carlos Fernando de Austria-Teschen.