A los veinticinco años contrajo matrimonio con Victoria Riva de Luna,[4] con la que tuvo cuatro hijos.
Estuvo casado posteriormente con Juana García-Courel Mendoza,[5] con la que tuvo dos hijos.
En 2002 se casó en terceras nupcias con Nuria González Sánchez con la que tuvo dos hijos.
[7][8][9][10][11][12][13][14][15][16] Fernando Fernández-Tapias sufrió la pérdida de su hijo Bosco José, que desapareció en el año 2010 mientras practicaba submarinismo y su cadáver fue encontrado por dos buzos en Lanzarote en 2012.
Trabajó como consejero de Unión Fenosa, Viajes Marsáns y Construcciones OHL.