[1] La temporada 2003/04, en Segunda División, dispuso de mayores oportunidades, jugando 25 partidos en los que anotó dos goles.
[1] La temporada terminó con un nuevo descenso del club vallecano, aunque Marqués pudo regresar a Primera al firmar con el Racing de Santander.
Aunque los madrileños tenían una opción de compra sobre el jugador, finalmente desestimaron su contratación por su elevado coste, 600.000 euros.
[3] Regresó al Racing la temporada 2005/06, como una apuesta personal del técnico Manolo Preciado,[4] quien le dio la titularidad en los primeros partidos de liga.
[8] Empezó jugando en el filial colchonero, gozando de la confianza del técnico Pepe Murcia.
[13] Finalizado su contrato, recibió una propuesta del Celtic de Glasgow, aunque finalmente el futbolista no se presentó a las pruebas.