Durante su estancia de seis años en el Fortín logró 5 títulos: el Torneo Clausura (2009 y 2011), el Torneo Inicial 2012, el Campeonato de Primera División 2012-13 y la Supercopa Argentina 2013.
[1] Después de varios partidos, Fernando no pudo adaptarse como querían.
En 2015 jugó casi todos los partidos del torneo paulista, pero una lesión muscular hizo que perdiera la titularidad.
Transcurrió el préstamo alternando su presencia entre los once iniciales y el banco de suplentes.
Logró asentarse en el primer equipo y jugó 22 partidos, recibiendo dos tarjetas roja.