Fernando era el sexto hijo y cuarto varón de la reina María II de Portugal y el rey consorte Fernando II el cual era miembro de la Casa de Sajonia-Coburgo-Gotha, por lo que el infante también era miembro.
No sé sabe mucho de su vida.
El infante Fernando murió de fiebre tifoidea o cólera a fines de 1861.
Fue enterrado en el Panteón Real de la Dinastía Braganza.
Estas sucesivas muertes, que fueron una tragedia agravadas por la enfermedad del nuevo rey Luis I, motivaron la redacción de un proyecto de ley enviado a las Cortes que estipulaba que las infantas podían suceder al trono y que Fernando II sería nombrado regente en caso de que muriera el rey Luis.