La temporada continuó con Trevor Gaskins y Alejandro Diez sumándose al equipo de cara a la Liga Nacional.
San Lorenzo comenzó la temporada 2020-2021 contratando al entrenador Silvio Santander[6] mientras que entre los jugadores estuvieron los extranjeros Luis Montero, Dar Tucker, Jeff Adrien y Justin Satchell, y entre los nacionales José Vildoza, Santiago Ferreyra, José Defelippo, Máximo Fjellerup, Christian Bihurriet, Jonathan Maldonado, Nicolás Aguirre, Agustín Caffaro, Facundo Piñero, Kevin Hernández y Nicolás Romano.
El primer torneo que disputó fue la Champions League 2019-20 donde perdió la semifinal ante Quimsa y quedó eliminado de la misma.
A pesar de su buena posición en la tabla, no logró acceder al Torneo Súper 20.
Integró el grupo C junto con Obras Basket y con SESI Franca de Brasil.
En Managua, Nicaragua, se disputaron los play-off, a encuentro único, y quedó eliminado por el São Paulo FC de Brasil.
El tercer segmento inició con mejoría para San Lorenzo, que anotó 20 puntos y redujo la desventaja (16-20, 51-49), pero la misma se acrecentó en el último período, donde Quimsa ganó 24 a 19 (75-68) y se quedó con el primer punto de la final.
Tal fue la diferencia entre los equipos que al final de los primeros dos cuartos, San Lorenzo ya estaba 53 a 31.
Brandon Robinson fue el jugador más destacado de Quimsa, goleador del equipo con 32 tantos.
Finalmente, Quimsa se impuso 90 a 83 y llevó la serie al quinto juego.