Era prima hermana del rey Luis XIV de Francia.
Francisca Magdalena nació en Saint-Germain-en-Laye, en las afueras de París.
Enfermó y murió en el Palacio Real de Turín siete meses más tarde, a la edad de 15 años, sin descendencia.
Fue enterrada en la catedral de Turín, donde descansa hoy en día.
Su esposo estaba inconsolable con su muerte y ordenó un funeral de lujo.