Francisco Ignacio Pugnaire de Iraola es un ecólogo español.
Su especialización es la ecología fisiológica y funcional.
Es editor de las revistas Journal of Vegetation Science y AOBPlants, y ha formado parte de los comités editoriales de Ecography, Ecosistemas, Frontiers in Plant Science, Scientific Reports y Web Ecology, así como al consejo editorial de The New Phytologist.
Ha sido gestor del Plan Nacional de Cooperación Internacional del MEC, presidente del Comité español de DIVERSITAS y representante en la European Platform for Biodiversity Research Strategy y en Biodiversa2.
Fue miembro de la dirección de la European Ecological Federation desde 2002 y posteriormente vicepresidente.