Ganó fama como fundador y presidente del partido de derecha alemán Die Republikaner.
Al mismo tiempo, presentó programas de televisión para la Bayerischer Rundfunk, como Gute Fahrt o Jetzt red ich.
[1] Sin embargo, el deterioro de los resultados dio lugar a conflictos internos y Schönhuber criticó a varios miembros del partido, incluyendo a Harald Neubauer, por haber tenido asociaciones con el Partido Nacionaldemócrata de Alemania (NPD), al que consideraba demasiado "nazi" y también "izquierdista", dado que había propuesto grandes planes de reforma social no compartidos por los republicanos más burgueses-nacionalistas y conservadores de Schönhuber.
Más tarde, Schönhuber retiraría sus duras críticas contra el NPD y sus principales políticos.
En 2001, junto con Horst Mahler, publicó el libro Schluss mit dem deutschen Selbsthass.