En su forma actual, no ha cambiado desde 1945 hasta el presente, cuando ambos países eran parte de la Unión Soviética.
Pasa por las proximidades de Valga (Estonia) y el cerro Suur Munamägi.
La frontera letona-estonia es custodiada por los guardias fronterizos en Valka, Ziemupe, Rūjiena y Ainaži.
Estonia, por ejemplo, reclamó zonas de Ape, Veclaicene, Valka, Lodos, Ipiķi y Ainaži.
Desde 2007, ambos países son miembros del área Schengen y los controles fronterizos no se están llevando a cabo en la frontera común, pues es posible cruzar en cualquier lugar.