El primer Patronato lo constituyeron:[2] En 2005, Ecologistas en Acción y SEO-BirdLife abandonaron el patronato de la Fundación por desacuerdos con su dirección.
Otros objetivos relacionados son la colaboración entre distintos colectivos acerca de la migración, la promoción de la investicación científica la potenciación del desarrollo sostenible y la formación.
[7] Entre los trabajos de la Fundación Migres se incluyen tanto asesorías como estudios sobre conservación.
La Fundación Migres ha trabajado como organismo asesor de proyectos con grandes impactos ambientales como Mina Cobre Las Cruces, la mina de Aznalcóllar para el grupo Magtel o el dragado del Guadalquivir para el Puerto de Sevilla.
[11] Migres firmó en 2005 un convenio con Red Eléctrica para desarrollar las medidas compensatorias de la instalación de un segundo cable submarino entre la península ibérica España y Marruecos (Proyecto REMO).