Genocidio de pueblos indígenas

En la segunda etapa, los recién llegados imponen su modo de vida al grupo indígena.

Durante este periodo, se calcula que un mínimo de 130 millones de indígenas murieron en masacres, violaciones masivas, hambrunas forzadas, guerras y esclavitud impuesta por los colonos europeos y diversas epidemias asociadas.

[12]​ Algunos académicos, entre ellos Lemkin, han argumentado que el genocidio cultural, a veces llamado etnocidio, también debe ser reconocido.

Los historiadores pueden entregar definiciones más amplias como la de Lemkin, quien ve a la violencia colonialista contra pueblos indígenas como inherentemente genocida.

[19]​ Otros argumentan que las terribles consecuencias de las enfermedades europeas entre muchas poblaciones del Nuevo Mundo fueron exacerbadas por formas diferentes de violencia, y que las muertes intencionadas e involuntarias pueden no ser fácilmente separadas.

En China, los zúngaros fueron eliminados de la estepa zungariana tanto como un estado como un pueblo, tras una "solución final" decretada por el gobierno central.

[26]​ En África, el Genocidio herero y namaqua, que eliminó hasta a un 70% del pueblo herero, fue llevado a cabo por el imperio alemán y fue el primer genocidio del s.xx.

Muchos pueblos originarios, como el Yuki, el Beothuk, y el Pallawah, fueron llevados al borde de extinción; en algunos casos, hubo tribus enteras aniquiladas.